2015年3月29日14时，新加坡为不久前去世的李光耀举行国葬仪式，几十位外国政要和新加坡数万名人民向这位新加坡的建国总理告别。
据新加坡当地channel8news电视新闻报道，3月29日大约300名来自本地主要宗教团体的代表来到新加坡宗教联谊会，向建国总理李光耀致上最后敬意。他们代表了佛教总会，回教传教协会等团体。蔡厝港集选区议员扎吉哈也出席了这项活动。与会者全体默哀一分钟悼念李先生，并感谢李先生在维护新加坡多元宗教和谐与稳定所作的努力。
宗教政策也是李光耀执政过程中谨慎对待的敏感部分之一，因为对于新加坡这样一个多种民族杂居、多种宗教共存、面积很小的地区来说宗教政策影响也十分巨大，否则将很容易陷入到民族与宗教双重冲突、政治与宗教混杂的危机之中。基督时报同工查阅了新加坡文献馆的《试论李光耀的宗教政策》，其中介绍说，在宗教政策方面，李光耀政府执行宗教信仰自由、多元一体的宗教政策、以及严格执行政教分离的原则。
中国宗教学者、中国人民大学魏德东教授在李光耀去世之后撰文点评说，李光耀对于宗教的态度和政策“可圈可点”。
除了宗教政策外，李光耀本人对于宗教也保持宽容的态度。他曾说，比起什么都不信来，有宗教信仰反而更好。《纽约时报》在2010年对于李光耀的报道中介绍说，李光耀曾经向朋友学习静坐，另外李光耀不是基督徒，但不妨碍他吸取基督教的婚姻与家庭思想，特别是对于婚姻誓言的持守。
对于李光耀的逝世，新加坡当地的基督教、天主教也表示哀悼和纪念。新加坡最大的超大型教会之一的新创世教会（New Creation Church）发布公告悼念李光耀，说：“与他的先锋领袖团队的伙伴们一起，李先生为‘现代新加坡’奠下基石，并且把他的一生委身于服务这个国家的人民。他的智慧与奉献为这个渺小的国家带来了不可思议的成长。他的确对这个国家而言是一个伟大的祝福（Blessing，意味从上帝而来的祝福）。”
